versta iemand da in het hoofdstuk van glycolyse- Rx3: fructokinase
Der sta: als de energiestatus laag is: wordt de activiteit van PFK verhoogd, dus wanneer ge weinig ATP hebt, wordt de PFK activiteit verhoogd
maar als voor de omzetting van fructose 6-p naar fructose1.6-bifosfaat, da dus wordt gestimuleerd door die PFK, ATP wordt gebruikt, dan kan de ATP status toch ni meer stijgen? Dan krijgt ge toch alleen nog maar een verlaging van de ATP status, dus blijft PFK toch altijd werken?
Ge moogt nooit een conclusie trekken op basis van 1 reactie op 1 tijdstip.
Ok, ge hebt veel AMP, weinig ATP, dus gaat fructokinase sterk geactiveerd zijn, en dus stuurt ge een G1P-molecule de glycolyse in...waarbij dagge begint om er ATP in te stoppen. Maar ge vergeet dan wel dat er na die ene reactie nog wel de Payoff Phase van de glycolyse volgt, waarbij 4 ATP's gevormd worden per glucosemolecule. Dus met de 2 diege er in de eerste 5 reacties instopt (waaronder die in de reactie diege aanhaalt) betekent dat al 2 winst. Daarna volgt nog de TCA Cycle (aka de Krebs) en de oxidatieve fosforylatie, waarbij dagge in totaal een goei 36 ATP's vormt...en de energiestatus dus na een tijdje wel verhoogt, en fructokinase wordt 'uitgeschakeld' als het hoog genoeg is. 1 ATP-tje opofferen voor 36 ATP's winst is dus wel de moeite.
__________________
Anatidaephobia: The fear that somewhere, somehow, a duck is watching you...
Hier nog een vraagje voor de kenners of voor de mensen met het handboek (dat ik dus niet heb)
In H4 vlak na de β-sheets, heeft onze aller prof. Dr. Yves Guisez het over β-turns, nu de slides geven niet echt duidelijkheid voor mij, wie kan me gewoon uitleggen wat dit is?
beta-turns zijn gewoon scherpe bochten in een eiwit, gewoonlijk gevormd met 4 residu's waaronder Pro (voor de scherpe hoek) en Gly (om plaats te sparen) De keto-O van residu 1 gaat daarbij een H-brug aan met de amino-H van Residu 4, waardoor ge ne stabielen bocht van ongeveer 180 graden krijgt. Die dingen zitten meestal buiten aan het eiwit, om de keten terug naar het centrum te sturen.
beta-turns hebben dus niks met beta-barrels of beta-sheets (al dan niet extended) te maken.
__________________
Anatidaephobia: The fear that somewhere, somehow, a duck is watching you...
Op slide 39 van water schrijft Guisez: " Een grote drijvende kracht achter de binding van een polair substraat en het complementair polair oppervlak van een enzym is de entropievermeerdering tijdens het proces waarbij geordende watermoleculen door het enzym van het substraat verdreven worden. " Moet da ni apolair substraat en apolair opp zijn? Die H2O op die tekening zijn toch geschikt zoals rond apolair?
Ik ben ze even op den Diefka site gaan pikken...Ge moet er wel rekening mee houden dat die een pak meer hebben gezien da wij. (ook Eiwitsynthese en afbraak dus) Kheb nie de moeite gedaan om die vragen er uit te halen, dus ge moet zelf een beetje zien
Biochemie: verbeterde versie
(In hoofzaak overzicht en samenhang v/d pathways. Aantal C`s v/d verschillende moleculen. Geen cycli opschrijven, maar belangrijke intermediairen, begin- en eindproduct kennen)
Bespreek de rol van glucose-6-P bij synthese en afbraak 3 mitochondriale (synthese+afbraak) processen Geef 3 vbn. van polysacchariden. Bespreek hun structuur en geef waar mogelijk de synthesepathway om tot de structuur te komen. Vgl. de rol van AcCoA, lactaat en ketolichamen in het metabolisme Geef een overzicht en indeling v/d vetten. Geef structuur waar mogelijk Bespreek de diversiteit binnen de vetten. ? structureel / energetisch Illustreer het belang van transportsystemen binnen de cel voor catabolisme pathways. Waar komt acetyl-coenzyme A voor in het metabolisme? Bespreek de transportmechanismen in het katabolisme. [ivm.shuttles] Bespreek de indeling van de lipiden Vergelijk gluconeogenese, glycolyse energetisch verbruik Vetzuurafbraak i.v.m. AZ afbraak? Afbraak van vetzuur i.v.m. ketogenese? Waar komt acetyl-coenzyme A voor in het metabolisme? Bespreek de transportmechanismen in het katabolisme. [ivm.shuttles] bespreek opbouw, karakteristieken, en hoe je de werking v enzymes kan beinvloeden. bespreek de energiekost bij reserve-aanmaak van suikers, vetten geef componenten van het celmembraan en hun functie. vergelijk gluconeogenese, glycolyse en eiwitsynthese qua energetisch verbruik of productie. Geef componenten van het celmembraan en hun functie. Afbraak van VZ i.v.m. ketogense Synthese van VZ (voor meristinezuur) bespreken Controlepathways vd glucosesynthese en de VZ synthese? Verband tss krebs, gluconeogenese & VZ synthese Welke shuttles om ATP te maken? (cfr.VZ) HMS (shunt) + diversiteit uitleggen Gluconeogenese, VZ synthese, shunt, krebs: gemeenschappelijk? vergelijk gluconeogenese, glycolyse en eiwitsynthese qua energetisch verbruik of productie. bespreek de energiekost bij reserve-aanmaak van suikers, vetten, eiwitten (dus de syntheses)
-- Edited by Rudolph the Giant Lobster at 13:28, 2006-06-24
__________________
Anatidaephobia: The fear that somewhere, somehow, a duck is watching you...